舟山市是一个重要的海港城市，其港口货物的进出口量非常大，因此，许多企业都需要使用EDI系统来进行电子数据交换。然而，在舟山市，如果企业没有EDI许可证，就无法使用EDI系统。那么，企业在舟山没有EDI许可证怎么办呢？

首先，企业需要了解什么是EDI许可证。EDI许可证是指企业在使用EDI系统之前需要向相关部门申请的一种许可证。这个许可证是由国家质量监督检验检疫总局批准发放的，其目的是为了保证EDI系统的安全可靠性，以及防止非法数据传输和信息泄露等问题。

如果企业没有EDI许可证，那么首先需要向当地质检部门进行申请。具体的申请流程和材料要求可以在当地质检部门的官方网站上查看。一般来说，申请人需要提供企业的营业执照、税务登记证、组织机构代码证等相关材料，以及填写申请表格并进行签名盖章。

申请提交后，质检部门会对企业进行现场检查，以确保企业的EDI系统符合相关标准和规定。如果检查合格，质检部门会发放EDI许可证。一般来说，整个申请过程需要1-2个月的时间。

在等待EDI许可证期间，企业可以考虑使用其他的电子数据交换方式，比如FTP、E-mail等。这些方式虽然不如EDI系统高效和安全，但是可以暂时替代EDI系统使用，以满足企业的基本需求。

总之，在舟山市，如果企业需要使用EDI系统，就必须要申请EDI许可证。虽然申请过程比较繁琐，但是这是保证数据安全和信息可靠性的必要措施。如果企业没有EDI许可证，可以先使用其他的电子数据交换方式，同时尽快向质检部门进行申请，以便尽快获得许可证并正常使用EDI系统。